Direktur : Prof. Noorhaidi, MA., M.Phil., Ph.D. 

Program Magister Prodi Interdisciplinary Islamic Studies (IIS)
Ketua : Ro'fah, S.Ag., BSW., MA., Ph.D.
Sekretaris : Dr. Roma Ulin Nuha, M.Hum.

Program Doktor Studi Islam
Ketua : Dr. Moch. Nur Ichwan, M.A.
Sekretaris : Ahmad Rafiq, M.Ag., MA., Ph.D.

Koordinator AAKK: Imam Mahmudi, S.H.I., M.IP.
Koordinator AUPK: Erie Susanty, SE., MM.